要进入稻妻水下区域，首先需要完成荒海地区的雷元素方碑解谜。五个雷元素方碑的激活顺序为：右边第二个击打两次，左边第二个击打两次，左边第一个击打两次，最后击打一次最左边石块。完成后方碑全部点亮，水位下降，露出通往水下区域的通道。这一步骤是探索水下锚点的前置条件，需确保角色具备雷元素攻击能力以激活机关。
水位下降后，需从中央大树旁的圆柱跳入地底空间。此处需使用道具留念镜照射三个小狐狸雕像触发机关，开启隐藏通路。注意地下空间存在多个解谜阵列，其中一个需要将五个发光面调整至同一方向才能解锁。该解谜耗时较长，需耐心观察图案规律。完成解谜后会出现通往水下的洞口，直接跳入即可进入水下区域。
水下区域的核心挑战在于踩格子机关。需站在触发格上，按特定顺序踩踏暗格且不重复，最终返回中心格。相邻房间还有更复杂的同类型解谜，需遵循相同逻辑。成功破解后水位完全退去，显露出隐藏的地道入口。地道尽头可激活水下传送锚点，但需先击败守护机关的小型BOSS。战斗中建议携带范围伤害角色应对群体敌人。
若需探索其他水下秘境如千来神祠洞窟，可从知比山传送点飞至洞底，沿箭头方向前进至尽头。部分水下雷神瞳需借助雷种子飞至高空后下落攻击获取。注意雷暴区域会持续造成伤害，建议搭配治疗角色或食物补给。稻妻水下地形错综复杂，建议优先解锁锚点以便后续探索，同时留意隐藏宝箱和键纹等收集要素的位置。
