S级忍者的强度主要取决于技能机制、实战表现以及版本适应性。当前版本中，波风水门九喇嘛连结凭借独特的瞬移机制和九尾查克拉强化效果成为T0级别选择，其技能组合包含无敌帧、防反能力和全图抓取特性，尤其在高端决斗场表现突出。该忍者一技能可短按瞬移或长按高抛苦无，二技能在金身模式下具备远距离位移和全图抓取效果，奥义技能螺旋闪光飞轮舞吼四式还能打断霸体状态敌人。
秽土三代、初代火影和四代雷影艾仍保持高强度定位。秽土三代拥有9个技能组合，金刚牢壁配合火遁能实现瞬间爆发；初代火影的木龙攻击和木巨人召唤具备霸体减伤效果；雷影的四豆状态可破霸体且大招后能衔接双技能。这些忍者在决斗场中具备稳定的先手和反打能力，但操作门槛相对较高，需要精准把握技能释放时机。
宇智波鼬系列忍者中，百战鼬凭借瞳力机制和低后摇特性占据特殊地位。其常规连招为一技能起手接4A上拉，高瞳力状态下可触发十拳剑追踪与天照组合技。该忍者4A仅1帧后摇且带无敌停帧效果，能有效克制体术突进型角色，但需注意幻术释放的节奏控制。须佐鼬虽情怀价值较高，但实战强度已逐渐落后于新晋S忍。
神秘面具男和白面具带土在特定场景下表现优异。面具男的虚化机制和喷火技能具有较强压制力，白面具则拥有零帧虚化与风火吸附特性，中场全屏奥义可快速终结对手。这类忍者依赖秘卷搭配，起手能力与秘卷强度直接相关，适合擅长中距离拉扯的玩家。
