进入晶洞世界后，首要任务是完成主线任务，这些任务会逐步教会玩家基本操作与核心机制。主线任务不仅提供经验奖励，还会赠送关键道具如青铜伙伴蛋，但需注意不要立即孵化，因为后续任务会赠送另一只更实用的伙伴。晶洞内无法使用坐骑、翅膀或宠物，生存依赖于氧气系统，需通过升级模块延长活动时间。洞穴分为5层，每层需穿越气闸进入，且存在月光石窟、凹陷日光宝库、嫩绿静脉三种独特地形，分别产出不同资源。
晶洞的核心玩法围绕模块系统展开，共有8种模块可升级至10级，包括氧气供应、挖掘工具、钩爪等。升级模块需要特定材料，例如月光石窟产出的月石、梦露，或日光宝库的炽石、太阳树液。模块升级后能显著提升效率，如万用工具升至10级可将挖掘范围从2x2扩大至3x3。氧气模块需优先强化，否则在深层洞穴会快速消耗生命值。锤击者模块能探测隐藏水晶，而护盾发生器可抵御爆炸植物伤害。
光辉圣物是重要目标，内含升级模组必备材料，而水晶圣物通常价值较低。巢穴中使用锤击者可发现额外水晶，5个火焰羽毛为朱砂书任务必备道具。圣物需通过喂食、治疗洞穴生物充能，充满后需带回主城圣物解析台开启，稀有圣物仅需2小时开启，普通圣物需6小时。催化剂能加速开启进程，每个减少2小时。
社交协作虽受限于洞穴机制，但可通过同步进入传送门实现组队。晶洞主城太阳探索者尖顶分为四层，包含模块锻造台、宠物孵化台等设施。伙伴系统分普通、特殊、稀有三档，黄金蛋必出稀有伙伴。重复任务可从Pebble助理处领取，奖励包含水晶与伙伴蛋。深层洞穴探索需高等级模块支持，死亡不会丢失已收集资源，但会中断当前进度。
